L'IMSP forme depuis 1989 pour le diplôme de Master en Didactique. Le recrutement se fait tous les deux ans. La sélection est très dure et le jury international en charge de ce dossier y met tout le sérieux depuis la création de l'IMSP. Les résultats sont là et montrent que l'IMSP est un centre de formation et de recherche où l'excellence est le slogan qui accompagne les enseignements au quotidien.
Le Diplôme de Master en Didactique des sciences a pour objectif l'acquisition de connaissances de haut niveau académique, pratique et professionnelle des Didactiques des disciplines scientifiques . Il articule, pour cela, un ensemble d'éclairages:
-théoriques sur la discipline de référence,
-pratiques en rapport avec le contenu disciplinaire,
-l'approfondissement des problématiques en éducation et d'une recherche donnant lieu à un mémoire.